Лазерные установки с самого начала своей истории считались достаточно опасными аппаратами, способными причинить значительный вред здоровью и даже быть угрозой жизни человека. Во время испытаний первого лазера Меймена было определено, что лазер является потенциально опасным аппаратом. На вопросы безопасности лазерных установок влияет в первую очередь лазерный материал, который может быть радиационным, а также сам луч лазера, который может повредить зрение человека, поскольку он поражает глаз и разрушает его, например, некоторые разновидности лучей лазера могут «выжигать» сетчатку глаза в течение секунд.
Учеными была разработана система маркировок безопасности лазеров, которая разделяет лазеры на классы по степени возможной опасности для человека: Класс 1 (относительно безопасные лазеры, например, в разного рода плеерах); Класс 2 (относительно безопасен при стандартной процедуре использования, обычно до 1 мВт); Класс 3 разделен на несколько подклассов – Класс 3а (до 5 мВт и предполагает, что существует небольшой риск повреждения глаз) и Класс 3б (может привести к непосредственному повреждению глаза); Класс 4 наиболее опасный класс лазеров, которые может жечь кожу, как следствие наиболее часто используется в индустриальных и научных целях.
Однако эта классификации используется для обозначения лазеров с лучом в видимом спектре, в то время как для пульсирующих и невидимых волн используется другая классификация. В частности, многие инфракрасные лазеры с длиной волны до 14 микрометров относят к безопасным.